Bioróżnorodność światowych oceanów znacznie przewyższa tę występującą na lądzie, a mimo to zdumiewająco niewiele wiadomo o podwodnych zasobach biologicznych naszej planety. W związku z tym w finansowanych przez UE projekcie badany jest potencjał drobnoustrojów morskich w kontekście biotechnologii przemysłowej.
Celem projektu "From sea-bed to test-bed: Harvesting the potential of marine microbes for industrial biotechnology" (
SEABIOTECH)
jest przeszukanie mórz pod kątem związków, na bazie których można
stworzyć nowe środki farmaceutyczne, kosmetyki, produkty spożywcze i
chemikalia przemysłowe. Do pobierania drobnoustrojów w pobliżu kominów
hydrotermalnych u wybrzeży Islandii i basenów głębinowych we wschodniej
części Morza Śródziemnego wykorzystano znormalizowany proces pobierania
próbek. Inne mikroorganizmy pobrano z niezbadanych dotąd obszarów u
wybrzeży Szkocji.
Partnerzy projektu, wśród których są małe średnie przedsiębiorstwa,
identyfikują i przezwyciężają główne przeszkody stojące na drodze do
pomyślnej eksploatacji morskich drobnoustrojów w biotechnologii
przemysłowej. Wymaga to poprawy jakości zasobów morskich dostępnych do
eksploatacji biologicznej, a także usprawnienia aspektów technicznych w
celu skrócenia czasu urynkowienia. W projekcie SEABIOTECH opracowane
zostaną także sposoby zrównoważonego wytwarzania produktów na skalę
przemysłową.
Badacze stworzyli scentralizowany bank danych służący do gromadzenia
informacji genomowych, chemicznych i dotyczących aktywności
biologicznej zgromadzonych drobnoustrojów, a także istniejących zbiorów.
Dokonali ponadto sekwencjonowania 13 genomów bakterii zebranych w
pobliżu kominów hydrotermalnych. Przeprowadzono także sekwencjonowanie
genomów z bakterii wyizolowanych z wody morskiej i z gatunku gąbki
morskiej Petrosia ficiformis.
Analiza wykazała, że badanie metabolitów występujących w bakteriach
żyjących w gąbkach może ułatwić ich selekcję i przyspieszyć odkrywanie
nowych leków. Odkryto przykładowo, że mikroorganizm Vibrio splendidus
działa silnie przeciw Mycobacterium marinum, swobodnie żyjącej bakterii
wywołującej zakażenia oportunistyczne u ludzi.
Projekt SEABIOTECH odegra ważną rolę w zapewnieniu Europie pozycji
lidera w dziedzinie biotechnologii. Przyczyni się także do stworzenia
europejskich przepisów sprzyjających zrównoważonej eksploatacji morskich
zasobów genetycznych, zgodnie z protokołem z Nagoi.