Spektrometria mas w naukach przyrodniczych
Ostatnio spektrometria mas stosowana jest do badania dużych i złożonych białek, co pozwala uzyskać niezwykłe informacje na temat markerów i procesów chorobowych. Dzięki szeroko zakrojonej współpracy między laboratoriami europejskimi i amerykańskimi powstają pionierskie zastosowania i metodologie.
Siła fizyczna potrzebna do odkształcenia toru lotu kamienia rzuconego w
powietrze jest powiązana z masą tego kamienia. Na podobnej zasadzie,
atomy mogą być odchylane przez pole magnetyczne, jeżeli zostaną najpierw
zjonizowane, a tym samym rozdzielone na swobodne ujemnie naładowane
elektrony i dodatnio naładowane jony. Wielkość pola magnetycznego
potrzebnego do ich przemieszczenia o określoną wartość zależy od ich
masy. Jest to prosta zasada wykorzystywana w spektrometrii mas,
technice, która jest stosowana od ponad stu lat do badania pierwiastków w
próbkach zjonizowanych w próżni.
Od niedawna możliwe jest zastosowanie tej metody do analizowania
złożonych i dużych makrocząsteczek biologicznych, takich jak białka
(proteomika oparta na spektrometrii mas). Kluczem było opracowanie
technik "miękkiej" jonizacji, które przekształcają makrocząsteczki w
jony. Proteomika oparta na spektrometrii mas rozwija się w
oszałamiającym tempie, otwierając drogę do badania podstawowych procesów
biologicznych.
Aby umocnić tę nową dziedzinę, powstał program wymiany i współpracy
między renomowanymi europejskimi i północnoamerykańskimi laboratoriami
badawczymi. Działania te realizowane są w ramach finansowanego przez UE
projektu "Integrating high performance mass spectrometry tools with
application in life science" (MSLIFE).
Uczestniczący w projekcie uczeni zajmują się stosowaniem
spektrometrii mas w naukach przyrodniczych, opracowywaniem nowych
technologii do identyfikacji biomarkerów chorób oraz integracją narzędzi
do spektrometrii mas z technologiami biochemicznymi i biomedycznymi.
Wśród badanych zagadnień znalazły się modyfikacje struktury białek
skutkujące patofizjologią, nieprawidłowe fałdowanie białek zależne od
konformacji oraz struktury rozpoznania molekularnego.
Prace w pierwszym okresie sprawozdawczym były szczególnie owocne.
Wyniki badań dotyczących opisania komórek układu nerwowego oraz nowych
narzędzi do szybkiej diagnostyki chorób dziedzicznych zostały już
opublikowane w czasopismach naukowych. Prace omawiane były też na
konferencjach krajowych i międzynarodowych.
Projekt MSLIFE umacnia więzi między renomowanymi laboratoriami
europejskimi i amerykańskimi dzięki wspólnym pracom w dziedzinie
proteomiki opartej na spektrometrii mas. Współpraca ta okazuje się
wyjątkowo owocna i ma doprowadzić do powstania nowych ważnych
metodologii, które pomogą w rozpoznawaniu i zwalczaniu chorób.
opublikowano: 2015-03-13